glmmTMB'giveCsparse'的每个模型中的警告
我正在使用 glmmTMB 库在 R 降价文档中运行混合模型。我运行的任何模型,都会收到以下警告:
'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
然后,如果我在控制台中运行代码,则会收到以下警告:
Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0), :
'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0), :
'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0), :
'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
我的代码如下所示:
m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group), data = bd, family = "poisson")
我尝试使用 重新安装 TMB 和 glmmTMB dependencies=TRUE,但该消息不断出现。显然它根本不会影响模型,但是无论我做什么测试或图表,我都会收到警告。有没有可能解决这个问题?或者我只是忽略它?
回答
这是无害的。你可以:
glmmTMB从 CRAN安装最新版本(目前为1.1.2)。- 忽略它
- 使用
suppressWarnings()(可能会丢失其他相关警告!) - 从 GitHub 安装开发版本,在此提交中已修复。(存储库中的二进制包现在也已更新。)
或者您可以将您的版本降级Matrix到旧版本(使用remotes::install_version()或snapshot包)