您好（这是我的第一条消息，所以如果有什么不对的地方，我很抱歉），

我已经有这个问题几天了。我无法安装新包，我读过一个类似的问题，但就我而言，问题仅在我尝试安装新的Bioconductor包时（或当我删除旧包并尝试重新安装时）发生。问题是我总是得到下一条消息的一些变化（在这个例子中我试图安装 ComplexHeatmap）：

BiocManager::install("ComplexHeatmap")

Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.0 (2020-04-24) 安装包'BiocVersion', 'ComplexHeatmap' 也安装依赖项 ?shape?, ?rjson?, ?BiocGenerics?, ? circlize?、?GetoptLong?、?colorspace?、?线索?、?RColorBrewer?、?GlobalOptions?、?png?、?Cairo?、?S4Vectors?、?IRanges?、?matrixStats?

无法打开 URL
'https://bioconductor.org/packages/3.12/data/annotation/bin/windows/contrib/4.0/PACKAGES.rds'：HTTP 状态为 '404 Not Found'Old packages: 'installr', 'boot ', 'class', 'cluster', 'codetools', 'foreign', 'KernSmooth', 'lattice', 'MASS', 'Matrix', 'mgcv', 'nlme', 'nnet', 'spatial', “生存”更新全部/部分/无？[a/s/n]：更新全部/部分/无？[a/s/n]：

它告诉我我必须安装 X 包，所以我输入“a”，然后发生了这种情况：

readRDS(dest) 中的错误：从连接读取错误

第一次尝试后，我只收到第二条消息，直到我重新启动 R。

我试过了：

• 开始 Rscripts（或 Rmarkdowns）的新会话
• 删除所有包（通过删除文件夹，直接）
• 卸载并重新安装 R 和 RStudio（尝试不同版本，R 降至 4.0）
• 重新启动 R 和计算机

我尝试安装以前版本的 BiocManager，但无法安装。一切都在更新。非常感谢您的关注，感谢您的帮助。

回答

install.packages("devtools")    
devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")