如何在单个函数中合并zcat和bzcat
我想构建一个可以处理 fastq.gz 和 fastq.bz2 文件的小辅助函数。
我想将 zcat 和 bzcat 合并为一个透明函数，该函数可用于两种文件：
zbzcat example.fastq.gz
zbzcat example.fastq.bz2
zbzcat() {
file=`echo $1 | `
## Not working
ext=${file##*/};
if [ ext == "fastq.gz" ]; then
exec gzip -cd "$@"
else
exec bzip -cd "$@"
fi
}
扩展提取工作不正常。您知道其他解决方案吗
回答
这些是相当多的问题：
file=`echo $1 | `给出一个语法错误，因为在 之后没有命令|。但是无论如何您都不需要命令替换。只需使用file=$1.ext=${file##*/}不是提取扩展名，而是提取文件名。要提取扩展名，请使用ext=${file##*.}.- 在您的检查中，您没有使用变量
$ext而是使用文字字符串ext。 - 通常，只有文件名中最后一个点之后的字符串才被视为扩展名。如果有
file.fastq.gz，那么扩展名是gz. 所以使用支票$ext = gz。fastq无论如何，未压缩的文件是文件与该功能无关。 exec用给定的命令替换 shell 进程。因此，在执行您的函数后，shell 将退出。只需执行命令。
顺便说一句：使用模式匹配时，您根本不必提取扩展名：
zbzcat() {
file="$1"
case "$file" in
*.gz) gzip -cd "$@";;
*.bz2) bzip -cd "$@";;
*) echo "Unknown file format" >&2;;
esac
}
或者，使用7z x它支持多种格式。大多数发行版都将包命名为p7zip.